U příležitosti Modlitby za domov 2009 přijaly církve duchovní záštitu nad Místními akčními skupinami. Zavázaly se tak k modlitební podpoře, ale i k partnerské spolupráci v dalších oblastech.
Losem byla určena tato partnerství
MAS Říčansko a Církev adventistů sedmého dne
MAS Střední Vsetínsko a Pravoslavná církev v Českých zemích a na Slovensku
MAS Chance in Nature a Bratrská jednota baptistů
MAS Přemyslovské Střední Čechy a Evangelická církev metodistická
MAS Karlštejnsko a Českobratrská církev evangelická
MAS Vladař a Jednota bratrská
MAS České Středohoří a Církev bratrská
MAS Pošembeří a Církev československá husitská
MAS Boskovicko plus a Starokatolická církev v ČR
MAS Podlipansko a Apoštolská církev
MAS Pošumaví a Slezská církev evangelická augsburského vyznání
MAS Lípa pro venkov a roudnická farnost Římskokatolické církve
MAS Vyhlídka a Evangelická církev augsburského vyznání